ژنومیکس در ابر
28 مرداد 1401
ارسال شده توسط گروه زیست داده کاو کدکول

دادههای مربوط به ژنومیکس در حال گسترش است. در سالهای اخیر سازمانهایی مانند موسسه ملی سلامت (NIH) که میزبان بیشتر از پنجاه پتابایت یا به عبارتی دیگر پنجاه میلیون گیگابایت از دادههای ژنومیکس بودهاند، در حال فراهم کردن زیرساختهای ابری جهت قرار دادن دادهها در دسترس جامعه پژوهشگران هستند.
چگونه ابزارها و پروتکلهای تجزیه تحلیل را برای دسترسی و آنالیز این حجم از دادهها در فضای ابری تطبیق داده میشوند؟
با این کتاب کاربردی، پژوهشگران کار با دادههای واقعی و چگونگی کار با الگوریتمهای ژنومیکس با استفاده از ابزارهای متن باز مانند، GATK، WDL، Doker، و Terra را یاد خواهند گرفت.
- پیشنیازهای ضروری ژنومیکس محاسباتی
- عملیات پایهای پردازش ابری
- شروع کار با GATK و سه تا از بهترین تمرینهای خط لوله GATK
- آنالیز اتوماتیک با استفاده از WDL و Cromwell
- بالا بردن جریان کاری اجرا در ابر، شامل پردازش موازی و بهینه سازی هزینهها
- آنالیز تعاملی در ابر با استفاده از ژوپیتر
اطلاعات بیشتر در مورد این کتاب:
دیدگاهتان را بنویسید
برای نوشتن دیدگاه باید وارد بشوید.