َشبیه سازی دینامیک مولکولی
این دوره مربوط به کلاس آنلاین دکتر سید شهریار عرب در سال 1399 می باشد و تنها در اختیار عزیزانی که در دوزه شرکت کرده بودند قرار گرفته و شامل پشتیبانی نمی باشد.
برنامه نویسی مقدماتی MATLAB
این زبان در بسیاری از حوزه ها از جمله محاسبات زیستی، شبکه های عصبی، پردازش تصویر، شیمی، هوش مصنوعی، منطق فازی، بهینه سازی و بسیاری از حوزه های دیگر کاربرد دارد و پژوهشگران و محققین این حوزه ها از متلب برای حل مسائل خود استفاده میکنند. سادگی انجام کار کارآیی مناسب در حل مسائل پیچیده از جمله دلایل محبوبیت این زبان بین پژوهشگران شده است.
هنر شبیه سازی دینامیک مولکولی با گرومکس
قوانین و معادلات از ریاضیات، فیزیک، شیمی و علوم کامپیوتر دست به دست یکدیگر داده‌اند تا پیچیدگی‌های دنیای زیستی را به تصویر بکشند و آزمایشگاهی نظری را برای مطالعه رفتار سیستم‌های زیستی فراهم آورند. در ابتدای امر شبیه‌سازی موکلول‌ها و ماکرومولکول‌های کوچک با روش شبیه‌سازی دینامیک مولکولی (MD) انجام می‌شد، اما هم اکنون مطالعه سیستم‌های پیچیده‌ای تا اندازۀ یک سلول کامل نیز امکان‌پذیر است. این تکنیک کاربردهای گسترده‌ای در زیست‌شناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک ساختاری دارد و هم به صورت مستقل جهت بررسی رفتار سیستم‌های زیستی استفاده می‌شود و هم به صورت کمکی در مطالعات آزمایشگاهی چون طراحی و اکتشاف دارو.
آنالیز شبکه‌های زیستی وزن دار با استفاده از پکیج WGCNA
آنالیز شبکه های همبستگی به عنوان یک روش زیست شناسی سامانه ای کاربرد بسیاری در حوزه بیوانفورماتیک از جمله آنالیز شبکه های هم بیانی ژن دارد.
