آنالیز شبکه های همبستگی به عنوان یک روش زیست شناسی سامانه ای کاربرد بسیاری در حوزه بیوانفورماتیک از جمله آنالیز شبکه های هم بیانی ژن دارد.

این آنالیز ها می توانند نقش کلیدی در شناسایی ژن ها با الگوی بیانی مشابه ایفا کنند. اهمیت شناسایی این ژن ها در بررسی ارتباط میان ژن ها از جمله تاثیر آنها در بیان یکدیگر و شناسایی مسیر های متابولیسمی مرتبط می باشد و می توان از نتایج آن جهت انتخاب بایومارکر ها برای ساخت دارو ، ارائه روش درمانی و یا  شناسایی زود هنگام سرطان ها استفاده کرد. 
 
پکیج WGCNA جهت آنالیز شبکه های همبستگی وزن دار توسعه داده شده است. این پکیج ابتدا ژن ها را بر اساس ارتباط میان بیانشان در نمونه های مختلف دسته بندی می کند. جهت دسته بندی ژن ها WGCNA ازhierarchical clustring  استفاده میکند. این پکیج ابتدا با روشی پویا به جداسازی کلاسترها از یکدیگر پرداخته و با دسته بندی Eigengene ها به ادغام ژن های مشابه می پردازد. Eigengene برداری است که با استفاده از PCA بر روی ژن های هر ماژول بدست می آید.
 
سپس با بررسی ویژگی های توپولوژیکی شبکه، ژن های هم بیان (ماژول) شناسایی می شوند. جهت بررسی ارتباط میان ماژول ها درون شبکه ای، ارتباط میان شبکه ها و ارتباط ماژول ها با ویژگی های قابل اندازه گیری پزشکی از eigengene استفاده می شود. 
 
با شناسایی ماژول های مهم در ارتباط با ویژگی های قابل اندازه گیری پزشکی می توان با استفاده از ابزارهایی نظیر DAVID به شناسایی مسیرهای متابولیسمی مرتبط پرداخت.
 
از قابلیت های ویژه WGCNA می توان به پردازش موازی داده ها، خروجی جهت نمایش گرافیکی شبکه ها در نرم افزار های cytoscape و VisANT اشاره کزد.
 
در این آموزش WGCNA به صورت صفر تا صد توضیح داده شده است.

چطور میتونم گواهی دوره دریافت کنم؟

جهت دریافت گواهی دوره کافی است به پشتیبانی درخواست ارسال کنید. ابتدا برای شما آزمون و یا پروژه ای تعریف        می شود و پس از تصحیح آزمون یا پروژه در صورت کسب حداقل نمره 70 از 100 به شما گواهی داده خواهد شد.

هزینه صدور گواهی 100 هزار تومان می باشد.

جلسه اول
جلسه دوم
جلسه سوم
مشاهده بیشتر

موارد مرتبط

یادگیری ماشین

بدون امتیاز 0 رای
دکتر جواد ظهیری
12:06:00
123
رایگان!

آموزش کاربردی CD-HIT

5.00 1 رای
نیلوفر سید مجیدی

ابزارCD-HIT به پژوهشگران کمک میکند تا هزینه محاسباتی آنالیزهای خود را به شدت کاهش داده، بسیار سریع بوده و می‌تواند پایگاه‌داده های بزرگ را نیز پردازش کند. از اهداف آن فهمیدن ساختار داده‌ها و حذف bias درون داده‌ها است.

00:31:12
27
رایگان!

طراحی محاسباتی دارو

بدون امتیاز 0 رای
دکتر سجاد قرقانی
10:59:00
34
550,000 تومان

آنالیز داده های RNA-seq

بدون امتیاز 0 رای
دکتر جواد ظهیری
19:40:00
70
600,000 تومان

نظرات

متوسط امتیازات

5
5.00 1 رای
رایگان!
1 نقد و بررسی

جزئیات امتیازات

5 ستاره
1
4 ستاره
0
3 ستاره
0
2 ستاره
0
1 ستاره
0

1 دیدگاه برای آنالیز شبکه‌های زیستی وزن دار با استفاده از پکیج WGCNA

  1. محمد عرفان زارع(خریدار محصول)

    خیلی وقت بود دنبال این آموزش می گشتم. ممنون از اشتراک گذاری

.فقط مشتریانی که این محصول را خریداری کرده اند و وارد سیستم شده اند میتوانند برای این محصول دیدگاه(نظر) ارسال کنند.

قیمت رایگان!

75 دانشجو
زبان: فارسی
01:27:55
۳ مبحث
۳ جلسه
سطح مطالعه: پیشرفته
video, pdf
162 مگابایت
امکان مشاهده آنلاین دوره
امکان دریافت گواهی دوره
دسترسی مادام العمر به دوره
2 دیدگاه 1630 بازدید
تاریخ انتشار: 12 تیر 1401
تاریخ بروزرسانی: 6 تیر 1401
امتیاز کاربران:
5.00 1 رای
دسته بندی
زیست شناسی محاسباتی/
برچسب ها
WGCNA/ آموزش رایگان/ آنالیز داده های بیان ژن/ بیوانفورماتیک/ شبکه های همبستگی/
لینک کوتاه :
https://codecool.ir/?p=8533
علیرضا دوست محمدی
علیرضا دوست محمدی
نمایش پروفایل
درباره مدرس

فارغ التحصیل کارشناسی ارشد رشته بیوانفورماتیک از دانشگاه تربیت مدرس

از این مدرس

آنالیز شبکه‌های زیستی وزن دار با استفاده از پکیج WGCNA

5.00 1 رای
علیرضا دوست محمدی

آنالیز شبکه های همبستگی به عنوان یک روش زیست شناسی سامانه ای کاربرد بسیاری در حوزه بیوانفورماتیک از جمله آنالیز شبکه های هم بیانی ژن دارد.

01:27:55
75
رایگان!